از جمله توانایی های شرکت مهندسی فراتجهیز در زمینه ی نرم افزار نویسی:
طراحی و برنامه نویسی کلیه ی پروژه های نرم افزاری تخصصی الکترونیک با نرم افزار های LABView و MATLAB
طراحی نرم افزارهای Monitoring ، Data Logging ، Data Analyser
طراحی و اجرای سیستم های پردازش تصویر تحت PC